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分享一个傻瓜式heatmap导出工具——HemI 1.0

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不明菲行物
不明菲行物  发表于 2015-4-5 02:52:31 |阅读模式

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分享一个傻瓜式heatmap导出工具——HemI 1.0
1.用户界面如下:
1.jpg

.
2.用户界面功能说明:
2.jpg

.
3.操作时,直接选用需要绘制热图的数据区域,支持excel文档
3.jpg

.
4.设置好基本的参数,如颜色、X/Y轴长度等以后,heapmap自动出现
4.jpg


.
5.准备好做一个你自己的热图了吗??
点开下面的网页下载安装,自己试试吧:
游客,如果您要查看本帖隐藏内容请回复

.
以上内容仅作交流学习使用



hemi.biocuckoo.org_download_HemI_Manual_Chn.pdf

1.11 MB, 下载次数: 22, 下载积分: 菲币 -2

售价: 1 菲币  [记录]

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发表于 2015-4-7 02:12:19 | 显示全部楼层

数据导入支持excel,只要拖动鼠标,选择数值数据区域即可,默认是不显示X轴和Y轴标题的,如果需要,可以指定哪一行是x轴,哪一列是y轴。

技巧1:导入数据前,先点击DEMO,选择好喜欢的色系,这样导入数据后,就直接以该色系画图了

然后,小伙伴们就可以自由的修改这个heatmap了,包括,X轴,Y轴标题角度,字体,整个图片旋转,边距等等,基本的需求都能满足。每次修改后,都需要点击REFRESH进行刷新。

技巧2:如果绘制热图的数据跨度比较大,比如从1到100都有,那么强烈推荐先对数据做归一化,这个可以放心,软件能自动帮你完成,只需要两步,

1). 选择option的statistic按钮


                               
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然后在这里选择log归一化的方式


                               
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2)点击Bar面板,选择“Auto Fill”按钮,再点ok,然后refresh一下就好



这个软件还可以做聚类。你可以根据需要选择对哪个轴做聚类,这个就不讲了,只要选择参数面板上的Clustering复选框就可以,简单明了。


导出图片,右键点击图片,你会看到导出选项,也是很简单,支持png,jpg,tiff,以及3种dpi,足够满足paper发表的质量。


这个工具还有一个小视频,可以去看下,如果实在不会的话。。。

http://hemi.biocuckoo.org/faq.php


(以上为转载)


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发表于 2015-10-19 16:15:47 | 显示全部楼层
itraqman 发表于 2015-4-7 02:12
数据导入支持excel,只要拖动鼠标,选择数值数据区域即可,默认是不显示X轴和Y轴标题的,如果需要,可以指 ...

大神 能给我发一个软件过来吗??不胜感激!!!511245753@qq.com   谢谢了大神
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发表于 2015-6-11 23:11:47 | 显示全部楼层
杨美玲 发表于 2015-6-8 11:03
大家好,我想下载HemI 1.0,但是需要购买,请问菲币如何挣到呢,新成员,不太明白,请大家帮忙,谢谢了
...

可以每日打卡也可以回帖获得
还有一些贴是回帖有奖励的~~
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发表于 2015-7-7 20:18:29 | 显示全部楼层
问个问题,选择数据的时候,怎么标注绿色的基因或者处理?都是黄色的数据区域!没有找到绿色的标注选项!!!最后图的X还是Y都没有相关基因的说明!
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发表于 2016-4-18 20:16:31 | 显示全部楼层
itraqman 发表于 2016-4-17 22:23
后来成功了没 刚才试了下可以下载啊

可以了,谢谢您,您会火山图么
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发表于 2015-4-5 02:55:04 | 显示全部楼层
感谢贡献吗,确实好用,给大家秀一下我用这个软件做的图:
test.tiff (124.08 KB, 下载次数: 2, 售价: 2 菲币)

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图做得不错,大家可以学习学习  发表于 2015-4-5 02:56
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发表于 2015-4-5 02:55:51 | 显示全部楼层
手动点赞
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发表于 2015-4-5 09:34:29 | 显示全部楼层
感觉挺好的
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发表于 2015-4-5 09:45:26 | 显示全部楼层
学习啦!

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发表于 2015-4-5 16:00:43 | 显示全部楼层
先回复看内容
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发表于 2015-4-5 16:07:10 | 显示全部楼层
我要 太好了!!!!
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发表于 2015-4-5 16:10:22 | 显示全部楼层
好东西啊 啊!!!!!!!!!

点评

希望以后多多支持  发表于 2015-4-5 16:23
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发表于 2015-4-5 17:04:44 | 显示全部楼层
好东西啊@@@
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发表于 2015-4-6 13:49:08 | 显示全部楼层
不错,这个软件还可以
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