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[其他] NEJM系列文章:关注临床基因检测审查问题

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发表于 2015-6-1 00:18:16 | 显示全部楼层 |阅读模式

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基因检测越来越多的被应用于临床,其监管问题也成为研究者们关心的热点。5月27日,新英格兰杂志在线发表系列文章集中讨论临床基因检测所面临的挑战等问题,特别是美国食品药品监督局(FDA)对临床基因检测的监管,包括乳腺癌风险评估和基因变异。

FDA与基因检测

来自Houston大学法律中心Barbara Evans和Washington大学的合作者们批评FDA对临床实验室里基因检测的监管。根据作者们的观点,FDA遵循医疗器械法规已有长达40年的历史,在此基础上寻求规范基因检测技术的监管,不能同时保证其安全性,有效性和创新性。

在产品上市前,如何有效评估由测序技术产生的大量变异基因与疾病之间的关系是现在面临的一大挑战。FDA建议使用现有的基因数据库进行验证,但作者认为,想法“过于乐观”。因为这些数据库,并没有包含大部分的基因变异。

由于在上市前,FDA要求证明临床有效性,随之引发的经济和时间成本问题会使得美国一些实验室分解检测过程,将部分环节交由海外机构完成,从而绕开FDA的监管。这很可能会“降低美国消费者的安全感”。

作者们认为:“在产品上市前,进行审查是不恰当的。FDA传统的逐个产品监管方式显得目光短浅的。基因检测需要一个持续数十年之久的计划,在不断学习中,发现大家还不知道的优势和风险。”因此,作者们建议,FDA应该考虑建立应用后的监测模型,确保检测机构使用监测药物的安全性。为了赋予新的变异基因在临床上的意义,FDA应通过公私合作的方式建立新的大规模数据资源,让研究者能够访问基因序列和表型数据,当然这将需要大量的资金。

目前尚不清楚FDA还将推出什么样的标准来加强监督那些已经达到美国临床实验室标准(CLIA)的实验室。此外,作者们认为,CLIA给了实验室较为宽松的权限,那么FDA也可以这样做。总之,改革的重点应放在如何正确指导FDA运用法律权力、资金,并鼓励公私合作发展以及维持数据资源,从而适当地监管基因组检测。
FDA的David Litwack和同事马上做出回应,在给编辑的信件中表达了对Evans的文章的看法,他们只接受部分观点:“我们不同意‘由于缺乏法定权威,FDA会阻碍创新’这种观点。FDA已经在证明,‘并非执着’于对基因检测进行以往传统的上市前审查。同时,FDA已经在寻求基因数据库开发。和CLIA的做法不一样,FDA不是监督实验室整体规范,而是关注具体的检测。”

乳腺癌风险预测

随着基因检测的逐步应用,越来越多的变异基因被发现,但在临床上很多变异却无法与疾病联系在一起。为患者提供基因检测可能不是一个最好的方式,而且其带来的风险是未知的。英国剑桥大学的Douglas Easton以及英国、美国、德国、澳大利亚、荷兰、和加拿大的合作者们在运用基因panel预测乳腺癌风险的文章中,提出了一个正好和Evans相反的观点:“基因检测不应该被运用到临床,除非其临床的有效性已经被确认。未经过监管部门的批准,没有经过临床验证,那么可能导致基因检测技术被滥用。”

2013年,美国最高法院的判定Myriad genetics公司拥有的BRCA1和BRCA2基因专利无效。此后,越来越多的实验室开始提供用panel来进行基因检测,评估乳腺癌风险。这些panel,其中还包括其他的癌症类型,包含超过100个基因,其中21个都声称是与乳腺癌相关。

这些检测结果背后的解读面临着一些困难,因为是否会患乳腺癌还受家族病史、年龄因素、生活方式等因素的影响。在重新研究过基因panel之后,作者们认为有些检测不准确,因此他们会告诫用户们使用乳腺癌风险预测panel的局限性。

ClinGen项目升级

为加速人们理解基因变异与疾病表型之间的关系,Partners HealthCare医疗集团分子医学实验室的Heidi Rehm和同事升级了美国国立卫生研究院(National Institutes of Health,NIH)的临床基因组资源(ClinGen) ,将其和两年前美国国家生物技术信息中心(NCBI)推出的ClinVar数据库结合到了一起。

ClinVar数据库包含145311条基因序列以及22864个变异基因。其中,有超过2000个变异基因,由不同的人员给予不同的解读;超过400个变异基因的临床评估也是不同的,可能会导致不同的医疗决策。因此还有很多额外的工作要做。为此,ClinVar正在采用新的实验室标准来规范遗传变异的解读,这要求提交者分享他们的评估理由。这些新标准将有助于专家达成共识。此外,ClinGen将组织一个工作小组,专门用标准程序来评估基因、变异、遗传和表型。新数据库被称为ClinGenKB让专家们能管理基因变异,并统一解读。FDA认为:“ClinGen将提供可靠的资源,为遗传变异找到临床解释。”

参考文献

The FDA and Genomic Tests — Getting Regulation Right
Gene-Panel Sequencing and the Prediction of Breast-Cancer Risk
The FDA and Genetic Testing
ClinGen — The Clinical Genome Resource

转自:测序中国
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发表于 2015-6-1 00:23:10 | 显示全部楼层
FDA的瞎咋呼
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发表于 2015-6-1 21:56:56 | 显示全部楼层
0.0    表示围观  FDA怒刷存在感
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发表于 2015-6-2 00:04:17 | 显示全部楼层
好贴~~赞一个
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发表于 2015-6-3 12:28:03 | 显示全部楼层
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发表于 2015-6-29 14:08:29 | 显示全部楼层

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发表于 2015-6-29 14:09:52 | 显示全部楼层

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发表于 2015-6-30 23:39:57 | 显示全部楼层
又是什么幺蛾子
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 楼主| 发表于 2015-6-30 23:40:15 | 显示全部楼层
相关部分整的挺正经
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发表于 2015-8-26 20:32:02 | 显示全部楼层
很有现实意义。
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